Dentre os impactos ecológicos de cianobactérias em comunidades aquáticas, destacam-se as alterações na estrutura da comunidade. Esta pesquisa objetivou avaliar a toxicidade aguda e crônica da água bruta da Lagoa do Peri, utilizando indicadores que refletem a saúde de um grupo de organismos, relacionando toxicidade e variáveis físico-químicas. Analisou-se descritores de qualidade da água, a toxicidade aguda ao organismo-teste Daphnia magna e realizou-se análise histológica de peixes das espécies Jenynsia lineata, através do monitoramento passivo, e Paracheirodon sp., através do biomoniotaramento ativo. A água da Lagoa do Peri apresentou-se tóxica em todas as amostragens realizadas, provocando efeito agudo ao zooplâncton exposto. A CE(I)50 48h variou de 7,95 a 70,71% e o FT de >16 a 4. Os valores de nutrientes para a lagoa foram considerados baixos e, provavelmente devido ao curto tempo de amostragem, não foi possível evidenciar um padrão de relação entre a toxicidade aguda e os dados de qualidade de água. A ictiofauna estudada não apresenta efeitos agudos ou crônicos à água da lagoa em estudo.